Western blot 實驗注意事項
1. 配膠時，建議先加水， 再加Tris-HCL緩沖液，并且每加一種液體就混勻膠液。加入的TEMED有毒，務必在通風櫥中操作， 并且加入后立即混勻、灌膠。丙烯酰胺未聚合的單體有神經(jīng)毒性， 能夠經(jīng)皮膚吸收， 需戴手套操作。
2. AP作為催化劑能夠提供氧自由基促使丙烯酰胺單體聚合， TEMED作為加速劑能夠促進AP釋放氧自由基，加速丙烯酰胺單體的聚合。空氣溫度較低時稍稍多加TEMED可加快膠的凝固速度，但要確保AP未變質，否則無效。
3. AP應現(xiàn)配現(xiàn)用， 否則變質會導致膠不聚合。另外， TEMED添加過量會使膠凝得過快并且孔徑大小不一，影響蛋白的電泳，甚至可能燒膠。
4. 電泳內槽中應加入新鮮的電泳液， 并且應先拔梳子再安裝入電泳槽， 添加電泳液。這樣能夠沖洗掉各孔中碎膠， 確保電泳時條帶平直。
5. 建議兩邊加入預染的Protein Marker，方便觀察不同KDa蛋白的分離情況，也方便后續(xù)的裁膜。
6. 電轉液中一般需加入甲醇或乙醇， 而電轉時的放熱會加速醇類的揮發(fā)進而影響下一次重復使用時的電轉效果。重復使用電轉液時應考慮到醇類的揮發(fā)而適當延長電轉時間， 最好是每次電轉時都使用新的電轉液。不同KDa的蛋白電轉的條件不同， 所以可以針對目的蛋白進行切膠， 然后在不同條件下電轉。
7. 蓋上PVDF膜后， 不要再輕易移動， 否則條帶會模糊。兩邊的濾紙不能相互接觸，接觸后會發(fā)生短路，蛋白會轉不過來。
8. 封閉常用脫脂奶粉或BSA，建議建議做磷酸化蛋白的western時使用BSA（牛血清蛋白） 作為封閉液。奶粉含有酪蛋白（一種磷酸化蛋白），如果用奶粉，有可能出現(xiàn)背景深的現(xiàn)象。并且脫脂奶粉含磷酸酶， 磷酸酶與膜上的磷酸化蛋白接觸可使之去磷酸化， 用磷酸化特異性抗體分析磷酸化蛋白時會受到影響。
9. 一抗在四度孵育時能夠延緩抗體的衰減速度， 提高重復利用的次數(shù)。建議嚴格按照要求進行洗膜， 不要輕易減少洗膜的次數(shù)和時間。Tween20作為一種非離子表面活性劑， 能夠減少非特異性的抗體結合， 降低背景。所以如果曝光后發(fā)現(xiàn)背景高，可以將1XPBST/TBST中Tween20從0.05%提高到0.5%，并且增加洗膜次數(shù)。
10. 曝光時盡量將目標蛋白和內參一起曝光， 便于比較。如果使用傳統(tǒng)的壓片曝光， 可以壓兩張甚至更多的片子并折角， 折角可以確定方向， 增加壓片數(shù)量可以控制曝光強度。離膜最近的片子記錄亮度低的蛋白條帶的情況， 離膜遠的蛋白可以保證亮度強的蛋白不過曝。
11. 曝光時多使用ECL發(fā)光試劑盒， 注意含量稀少的磷酸化蛋白等可以使用超敏型試劑以增加亮度， 而內參等含量較多的蛋白則應使用普通的ECL發(fā)光試劑防止過亮，阻礙曝光。
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